Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POP1Q99575 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POP1Q99575 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POP1Q99575 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POP1Q99575 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POP1Q99575 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms