Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOTCH4Q99466 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTCH4Q99466 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms