Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms