Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSRNP1Q96S65 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms