Protein–RNA interactions for Protein: Q96PT4

DUX3, Putative double homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX3Q96PT4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUX3Q96PT4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUX3Q96PT4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms