Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP4Q96PP9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP4Q96PP9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms