Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRRC7Q96NW7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC7Q96NW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms