Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMD11Q96NU1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms