Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TSNARE1Q96NA8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms