Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF488Q96MN9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms