Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EP400Q96L91 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EP400Q96L91 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms