Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJD4Q96KN9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms