Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPGRIP1Q96KN7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPGRIP1Q96KN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms