Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCHS1Q96JQ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DCHS1Q96JQ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms