Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMX3Q96JJ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms