Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZC2HC1AQ96GY0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZC2HC1AQ96GY0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms