Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BORCS6Q96GS4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BORCS6Q96GS4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms