Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BICD1Q96G01 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms