Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PGAP3Q96FM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGAP3Q96FM1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms