Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms