Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHFRQ96EP1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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CHFRQ96EP1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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CHFRQ96EP1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHFRQ96EP1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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