Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAF2Q96CS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAF2Q96CS3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms