Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCC1Q96CN9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCC1Q96CN9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms