Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYTL4Q96C24 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYTL4Q96C24 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYTL4Q96C24 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYTL4Q96C24 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYTL4Q96C24 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYTL4Q96C24 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms