Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC74AQ96AQ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC74AQ96AQ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms