Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1AQ96AJ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTI1AQ96AJ9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms