Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC59Q96AG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC59Q96AG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms