Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 HAUS7-209ENST00000490453 586 ntTSL 316.79■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.47■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-215ENST00000533234 554 ntTSL 416.29■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-213ENST00000448410 1104 ntTSL 315.84■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HAUS7-206ENST00000464993 851 ntTSL 215.61■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 415.32■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-202ENST00000546695 722 ntTSL 315.28■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-207ENST00000525898 1405 ntTSL 515.25■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-212ENST00000530601 581 ntTSL 315.07■□□□□ 05e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 315.03■□□□□ -05e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 214.97□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-215ENST00000551959 483 ntTSL 414.97□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-213ENST00000530931 891 ntTSL 314.85□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NCOR2-206ENST00000418829 563 ntTSL 314.36□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NCOR2-211ENST00000443451 951 ntTSL 514.36□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 514.28□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-209ENST00000566510 2661 ntTSL 514.18□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-216ENST00000533721 774 ntTSL 414.14□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-206ENST00000558840 554 ntTSL 414.07□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-204ENST00000585975 944 ntTSL 514.05□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC38A10-204ENST00000539748 528 ntTSL 313.7□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 413.68□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.67□□□□□ -0.225e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-204ENST00000577597 2024 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 213.62□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 55
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TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-203ENST00000585436 1652 ntTSL 513.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 413.31□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 213.2□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CD82-208ENST00000526958 538 ntTSL 413.16□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 HAUS7-208ENST00000490165 817 ntTSL 312.93□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 NBEAL1-210ENST00000497505 2372 ntTSL 512.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TADA3-205ENST00000492103 1868 ntTSL 212.67□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 WDR61-212ENST00000560569 1036 ntTSL 512.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 OSBPL5-213ENST00000530372 575 ntTSL 412.44□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP1A3-202ENST00000441343 3818 ntTSL 212.04□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-210ENST00000566612 4138 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 TMEM8A-203ENST00000427313 587 ntTSL 411.74□□□□□ -0.535e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 411.49□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-206ENST00000427084 749 ntTSL 511.45□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SATB1-AS1-262ENST00000629984 759 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 S100PBP-202ENST00000373475 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP1A3-207ENST00000543770 3427 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 ATP1A3-209ENST00000602133 3458 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CBFA2T2-202ENST00000344201 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 DENND1A-212ENST00000497135 1207 ntTSL 510.52□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 SLC25A17-210ENST00000435456 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 55
TBRG4Q969Z0 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 410.33□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 55
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