Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
UTP4Q969X6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UTP4Q969X6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms