Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHF3Q92576 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms