Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAPGEF5Q92565 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAPGEF5Q92565 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms