Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSPC1Q8WXF1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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