Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf54Q8WWF1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf54Q8WWF1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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