Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRIM41Q8WV44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
TRIM41Q8WV44 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRIM41Q8WV44 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms