Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF4Q8WV16 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms