Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX54Q8TDD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms