Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA3Q8TBC4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBA3Q8TBC4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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