Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMO3Q8TAP4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMO3Q8TAP4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms