Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATL2Q8NHH9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL2Q8NHH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms