Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF397Q8NF99 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF397Q8NF99 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms