Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHDC9Q8NEP7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHDC9Q8NEP7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms