Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EHBP1Q8NDI1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EHBP1Q8NDI1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms