Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HJURPQ8NCD3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HJURPQ8NCD3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms