Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RNF182Q8N6D2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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RNF182Q8N6D2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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RNF182Q8N6D2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF182Q8N6D2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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