Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IGSF1Q8N6C5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
IGSF1Q8N6C5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms