Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP1Q86W92 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP1Q86W92 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms