Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
YTHDF3Q7Z739 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
YTHDF3Q7Z739 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms