Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSX7Q7RTT5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX7Q7RTT5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms