Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HS2ST1Q7LGA3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms