Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PREX2Q70Z35 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PREX2Q70Z35 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms